Le directeur général est le trait d'union entre le Comité de gestion provincial et les différents services du BSDQ. Il voit à la réalisation de la mission du BSDQ ainsi que des divers mandats qui lui sont confiés par les trois propriétaires (ACQ, CMEQ, CMMTQ). Il est également imputable des différents départements, offrant un soutien constant à toutes les équipes. Le développement et la réalisation du plan stratégique ainsi que les relations publiques sont aussi sous sa responsabilité.
Le directeur des opérations a sous sa responsabilité deux grands départements, le Service aux usagers et le Service de l'application. D’abord, le Service aux usagers offre un soutien aux utilisateurs quant à l’usage de la TES, l’ouverture des projets et les accompagne dans le processus de transmission des soumissions. Le Service de l’application, pour sa part, offre un soutien en lien avec l’application des règles du Code de soumission ainsi que la compilation des soumissions reçues. Il s’agit également d’un service d’enquête recevant les plaintes des usagers qui considèrent que des règles du Code de soumission n'ont pas été respectées par d’autres entrepreneurs engagés au BSDQ.
La directrice du Service administratif supervise tout ce qui a trait à l’administration, aux ressources humaines, à la comptabilité et à la facturation, incluant la gestion des garanties de soumission, ainsi que l’engagement des usagers. La direction de l’administration voit à la gestion des biens de l’organisation, à l’approvisionnement, à l’utilisation optimale des effectifs en place tout en assurant un environnement de travail sain, agréable et équitable. Le département administratif est également responsable de la recherche sur l’octroi des contrats.
La chef est responsable des communications externes et internes de l'organisation qui comprennent notamment les placements médias, la visibilité au sein de l’industrie, la recherche marketing, les relations de presse, la gestion des réseaux sociaux, la gestion du site Internet ainsi que la création de divers outils de communication. Elle a aussi sous sa responsabilité divers partenariats et événements de l'industrie de la construction. Elle voit à l’accomplissement des grands objectifs marketing pour la pérennité de l’organisme.